Responsables Scientifiques : Carole Camarasa & Jean-Roch Mouret
Nos recherches portent donc sur l’étude des spécificités phénotypiques des différentes espèces de levures œnologiques et sur la compréhension de leur métabolisme ainsi que sur le développement de modes de contrôle de la fermentation innovants : gestion de la température, nutrition des levures, inoculation séquentielle de différentes espèces, contrôle prédictif basé sur la modélisation des principaux mécanismes…
Deux thématiques de recherche complémentaires…
- Spécificités phénotypiques et fonctionnement du métabolisme des levures œnologiques
Un volet important de nos travaux est focalisé sur la compréhension du métabolisme et de sa régulation chez la levure Saccharomyces cerevisiae, qui est l’acteur microbien majeur de la fermentation œnologique. Il s’agit d’une part de déterminer l’origine métabolique des arômes fermentaires majeurs (alcools, esters) et de molécules volatiles plus atypiques et d’autre part, d’analyser l’incidence de paramètres environnementaux sur l’orientation des métabolismes carboné, azoté et des arômes.
Nos recherches s’intéressent également aux levures œnologiques non-Saccharomyces, qui, de par leurs propriétés phénotypiques particulières, peuvent contribuer à la qualité des vins. L’objectif est d’explorer la diversité phénotypique de ces espèces, en terme de production de métabolites, d’enzymes hydrolytiques mais aussi de besoins nutritifs, afin de mieux exploiter leurs potentialités dans le contexte de la fermentation œnologique.
- Contrôle du procédé de fermentation œnologique pour moduler le profil aromatique des vins
Notre objectif est de proposer des nouvelles stratégies de conduite de la fermentation œnologique visant à améliorer la qualité des vins, en intégrant les contraintes liées à l’environnement qui modulent la dynamique fermentaire mais aussi le métabolisme des levures. Dans ce contexte, l’incidence de macromolécules de la matière première (polyphénols, bourbes…) ou de paramètres technologiques sur la cinétique fermentaire ou de formation de molécules cibles est analysée.
L’ensemble de nos connaissances sont ensuite utilisées pour construire un modèle de la cinétique fermentaire et de la production d’arômes, avec pour objectif une gestion prédictive et optimisée du procédé et une modulation de la composition des vins.
… s’appuyant sur un développement d’outils et de méthodologies
- Outils de fermentation* :
- Fermentations à différentes échelles de 10 mL à 100 L, avec suivi en ligne de l’activité fermentaire
- Fermenteurs équipés d’un système de suivi en ligne de production de molécules volatiles par chromatographie gazeuse
- Fermenteur continu multi-étagé
- Système d’information ALFIS : accès à distance et base de données
* : Les dispositifs à l’échelle pilote sont situés à l’Unité Expérimentale de Pech-Rouge
- Développement de méthodes d’analyses fines pour la quantification de molécules à l’état de trace
- Analyse quantitative du métabolisme et de sa régulation
- Profil d’expression génique
- Traçage isotopique 13C, 15N
- Modélisation prédictive basée sur la combinaison de modèles phénoménologiques, stœchiométriques et physico-chimiques.
Contacts:
Personnels :
Chercheurs, Enseignants-Chercheurs et Ingénieurs :
- Audrey Bloem
- Carole Camarasa (Resp. d’équipe)
- Erick Casalta
- Vincent Farines
- Jean-Roch Mouret (Resp. d’équipe)
- Marc Perez
- Fabienne Remize
Assistants-Ingénieurs et Techniciens :
- Pascale Fernandez-Valle
- Faiza Macna
- Christian Picou
Doctorants :
- Rafael Alvarez
- Julie Aragno
- Andréa Cesson
- Mehmet Gazaloglu
- Tristan Jacqui
- Viwe Tyibilika
Ancien doctorants :
Publications :
2022
Dournes G., Verbaere A., Lopez F., Dufourcq T., Mouret J.R., Roland A. (2022) First characterisation of thiol precursors in Colombard and Gros Manseng: comparison of two cultivation practices. Australian Journal of Grape and Wine Research, Doi: 10.1111/ajgw.12547
Eder M., Sanchez I., Camarasa C., Daran J.M., Legras J.L., Dequin S. (2022) Genetic bases for the metabolism of the DMS precursor S-methylmethionine by Saccharomyces cerevisiae. Food Microbiol., 106: 104041
Girardi-Piva G, Casalta E, Legras J-L, Nidelet T, Pradal M, Macna F, Ferreira D, Ortiz-Julien A, Tesnière C, Galeote V and Mouret J-R (2022) Influence of ergosterol and phytosterols on wine alcoholic fermentation with Saccharomyces cerevisiae strains. Front. Microbiol. 13:966245. doi: 10.3389/fmicb.2022.966245
Girardi Piva G., Casalta E., Legras J.L., Tesnière C., Sablayrolles J.M., Ferreira D., Ortiz‐Julien A., Galeote V., Mouret J.R. (2022) Characterization and role of sterols in Saccharomyces cerevisiae during white wine alcoholic fermentation. Fermentation, 8: 90. Doi: 10.3390/fermentation8020090
Godillot J., Sanchez I., Perez M., Picou C., Galeote V., Sablayrolles J.M., Farines V., Mouret J.R. (2022) The timing of nitrogen addition impacts yeast genes expression and the production of aroma compounds during wine fermentation. Frontiers in Microbiology, 13: 829786. Doi: 10.3389/fmicb.2022.829786
Guittin C., Maçna F., Sanchez I., Barreau A., Poitou X., Sablayrolles J.M, Mouret J.R, Farines V. (2022) The impact of must nutrients and yeast strain on the aromatic quality of wines for cognac distillation. Fermentation, 8:51, https://doi.org/10.3390/fermentation8020051.
Jimenez-Lorenzo R., Farines V., Sablayrolles J.M., Camarasa C., Bloem A. (2022) New insights into the origin of volatile sulfur compounds during wine fermentation and their evolution during aging. Fermentation, 8:139.
Leborgne C., Lambert M., Ducasse M.A., Meudec E., Verbaere A., Sommerer N., Boulet J.C., Masson G., Mouret J.R., Cheynier V. (2022) Elucidating the color of rosé wines using polyphenol-targeted metabolomics. Molecules, 27, 1359. Doi: 10.3390/molecules27041359
Mbuyane L., Bauer F., Bloem A., Camarasa C., Ortiz-Julien A., Divol B. (2022) Species-dependent metabolic response to lipid mixtures in wine yeasts. Front Microbiol., 13: e823581.
2021
Casalta E., Mouret J.R., Sablayrolles J.M. (2021) Le contrôle de la fermentation alcoolique en conditions œnologiques : L’azote oui mais. Revue des Oenologues, 181, 38-41.
Guittin C., Maçna F., Sanchez I., Poitou X., Sablayrolles J.M., Mouret J.R., Farines V. (2021). Impact of high lipid contents on the production of fermentative aromas during white wine fermentation. Applied Microbiology and Biotechnology, 105(16), 6435-6449.
Jimenez-Lorenzo R., Bloem A., Farines V., Sablayrolles J.M., Camarasa C. (2021) How to modulate the formation of negative volatile sulfur compounds during wine fermentation ? FEMS Yeast Res. 21:foab038.
Mouret J.R., Aguera E., Perez M., Farines V., Sablayrolles J.M. (2021) study of oenological fermentation : which strategy and which tools? Fermentation, 7: 155 Doi: 10.3390/fermentation7030155
Ochando T., Mouret J.R., Humbert-Goffard A., Aguera E., Sablayrolles J.M., Farines V. (2021) Etude dynamique de l’interaction entre le SO2 et l’acétaldéhyde au cours de la fermentation alcoolique. Revue des Œnologues, 178, 45 – 48.
Rollero S., Bloem A., Brand J., Ortiz-Julien A., Camarasa C., Divol B. (2021) Nitrogen metabolism in three non-conventional wine yeast species : A tool to modulate wine aroma profiles. Food Microbiol., 94:103650.
2020
Bergler G., Nolleau V., Picou C., Perez M., Ortiz-Julien A., Brulfert M., Camarasa C., Bloem A. (2020) Dispersive liquid-liquid microextraction for the quantitation of terpenes in wine. J Agric Food Chem. doi: 10.1021/acs.jafc.9b08222.
Duc C., Maçna F., Sanchez I., Galeote V., Delpech S., Silvano A., Mouret J.M. (2020) Large-scale screening of thiol and fermentative aroma production during wine alcoholic fermentation: Exploring the effects of assimilable nitrogen and peptides. Fermentation 6, 98; doi:10.3390/fermentation6040098.
Eder M., Nidelet T., Sanchez I., Camarasa C., Legras J.L., Dequin S. (2020) QTL mapping of modelled metabolic fluxes reveals gene variants impacting yeast central carbon metabolism. Sci Rep. 10(1):2162. doi: 10.1038/s41598-020-57857-3.
Harle O., Legrand J., Tesniere C., Pradal M., Mouret J.R. and Nidelet T. (2020) Investigations of the mechanisms of interactions between four non-conventional species with Saccharomyces cerevisiae in oenological conditions. Plos One. 15: 5.
Ochando T., Mouret J.R., Humbert-Goffard A., Aguera E., Sablayrolles J.M., Farines V. (2020) Comprehensive study of the dynamic interaction between SO2 and acetaldehyde during alcoholic fermentation. Food Research International Volume 136, 109607.
Seguinot P., Bloem A., Brial P., Meudec E., Ortiz-Julien A., Camarasa C. (2020) Analysing the impact of the nature of the nitrogen source on the formation of volatile compounds to unravel the aroma metabolism of two non-Saccharomyces strains. Int J Food Microbiol. 316:108441. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2019.108441.
Seguinot P., Ortiz-Julien A., Camarasa C. (2020) Impact of nutrient availability on the fermentation and production of aroma compounds under sequential inoculation with M. pulcherrima and S. cerevisiae. Front Microbiol. 11:305. doi: 10.3389/fmicb.2020.00305.
Su Y., Seguinot P., Bloem A., Ortiz-Julien A., Heras J.M., Guillamón J.M., Camarasa C. (2020) Isotopic tracers unveil distinct fates for nitrogen sources during wine fermentation with two Non-Saccharomyces strains. Microorganisms, 16;8(6):E904. doi: 10.3390/microorganisms8060904.
Su Y., Seguinot P., Sanchez I., Ortiz-Julien A., Heras J.M., Querol A., Camarasa C., Guillamón J.M. (2020) Nitrogen sources preferences of non-Saccharomyces yeasts to sustain growth and fermentation under winemaking conditions. Food Microbiol. doi: 10.1016/j.fm.2019.103287.
2019
Mekoue Nguela J, Vernhet A, Julien-Ortiz A, Sieczkowski N, Mouret JR. 2019.Effect of grape must polyphenols on yeast metabolism during alcoholic fermentation. Food Res Int. 85:103287. 121:161-175. doi: 10.1016/j.foodres.2019.03.038.
Rollero S, Bloem A, Ortiz-Julien A, Bauer FF, Camarasa C, Divol B. 2019.A comparison of the nitrogen metabolic networks of Kluyveromyces marxianus and Saccharomyces cerevisiae. Environ Microbiol. 21:4076-4091. doi: 10.1111/1462-2920.14756.
Seguinot P, Bloem A, Brial P, Meudec E, Ortiz-Julien A, Camarasa C. 2019. Analysing the impact of the nature of the nitrogen source on the formation of volatile compounds to unravel the aroma metabolism of two non-Saccharomyces strains. Int J Food Microbiol. 316:108441. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2019.108441.
Su Y, Seguinot P, Sanchez I, Ortiz-Julien A, Heras JM, Querol A, Camarasa C, Guillamón JM. 2020. Nitrogen sources preferences of non-Saccharomyces yeasts to sustain growth and fermentation under winemaking conditions. Food Microbiol. doi: 10.1016/j.fm.2019.103287.
2018
Aceves C, Athes V, Buche P, Della Valle G, Farines V, Fonseca F, Guillard V, Kansou K, Kristiawan M, Monclus V, Mouret JR, Ndiaye A, Neveu P, Passot S, Penicaud C, Sablayrolles JM, Salmon JM, Thomopoulos R, Trelea IC. (2018). The virtual food system: Innovative models and experiential feedback in technologies for winemaking, the cereals chain, food packaging and eco-designed starter production. Innovative Food Science and Emerging Technologies 46: 54–64.
Aguera E, Sire Y, Mouret JR, Sablayrolles JM, Farines V. (2018). Comprehensive study of the evolution of the gas-liquid partitioning of acetaldehyde during wine alcoholic fermentation. J Agric Food Chem. doi: 10.1021/acs.jafc.8b01855.
Bloem A, Rollero S, Seguinot P, Crépin L, Perez M, Picou C, Camarasa C. (2018). Workflow based on the combination of isotopic tracer experiments to investigate microbial metabolism of multiple nutrient sources. J Vis Exp. 22;(131). doi: 10.3791/56393.
Brice C, Cubillos FA, Dequin S, Camarasa C, Martínez C. (2018). Adaptability of the Saccharomyces cerevisiae yeasts to wine fermentation conditions relies on their strong ability to consume nitrogen. PLoS One. 13(2):e0192383. doi: 10.1371/journal.pone.0192383.
Camarasa C, Chiron H, Daboussi F, Della Valle G, Dumas C, Farines V, Floury J, Gagnaire V, Gorret N, Leonil J, Mouret JR, O'Donohue MJ, Sablayrolles JM, Salmon JM, Saulnier L, Truan G. (2018). INRA's research in industrial biotechnology: for food, chemicals, materials and fuels. Review article. Innovative Food Science and Emerging Technologies 46: 140–152.
Eder M, Sanchez I, Brice C, Camarasa C, Legras JL, Dequin S. (2018). QTL mapping of volatile compound production in Saccharomyces cerevisiae during alcoholic fermentation. BMC Genomics 19(1):166. doi: 10.1186/s12864-018-4562-8.
Englezos V, Cocolin L, Rantsiou K, Ortiz-Julien A, Bloem A, Dequin S, Camarasa C. (2018). Specific phenotypic traits of Starmerella bacillaris regarding nitrogen source consumption and central carbon metabolites production during wine fermentation. Appl. Environ. Microbiol. doi:10.1128/AEM.00797-18.
Legras J-L, Galeote V, Bigey F, Camarasa C, Marsit S, Nidelet T, Sanchez I, Couloux A, Guy J, Franco-Duarte R, Marina MH, Gabaldon T, Schuller D, Sampaio JP, Dequin S. (2018). Adaptation of S. cerevisiae to fermented food environments reveals remarkable genome plasticity and the footprints of domestication. Mol Biol Evol. doi: 10.1093/molbev/msy066.
Ochando T, Mouret JR, Humbert-Goffard A, Sablayrolles JM, Farines V. (2018). Vicinal diketones and their precursors in wine alcoholic fermentation: Quantification and dynamics of production. Food Res Int. 103:192-199. doi: 10.1016/j.foodres.2017.10.040.
Rollero S, Bloem A, Ortiz-Julien A, Camarasa C, Divol B. (2018). Altered fermentation performances, growth, and metabolic footprints reveal competition for nutrients between yeast species inoculated in synthetic grape juice-like medium. Front Microbiol. 9:196. doi: 10.3389/fmicb.2018.00196.
Rollero S, Bloem A, Ortiz-Julien A, Camarasa C, Divol B. (2018). Fermentation performances and aroma production of non-conventional wine yeasts are influenced by nitrogen preferences. FEMS Yeast Res. doi: 10.1093/femsyr/foy055.
Seguinot P, Rollero S, Sanchez I, Sablayrolles JM, Ortiz-Julien A, Camarasa C, Mouret JR. (2018). Impact of the timing and the nature of nitrogen additions on the production kinetics of fermentative aromas by Saccharomyces cerevisiae during winemaking fermentation in synthetic media. Food Microbiology 76: 29e39. doi.org/10.1016/j.fm.2018.04.005.
2017
Crépin L, Truong NM, Bloem A, Sanchez I, Dequin S, Camarasa C. (2017). Management of multiple nitrogen sources during wine fermentation by Saccharomyces cerevisiae. Appl Environ Microbiol. 83(5). pii: e02617-16. doi: 10.1128/AEM.02617-16.
Dequin S, Escudier JL, Bely M, Noble J, Albertyn W, Masneuf-Pomarède I, Marullo P, Salmon JM, Sablayrolles JM. (2017). How to adapt winemaking practices to modified grape composition under climate change conditions? OenoOne, 51:205-214.
Mendes I, Sanchez I, Franco-Duarte R, Camarasa C, Schuller D, Dequin S, Sousa MJ. (2017). Integrating transcriptomics and metabolomics for the analysis of the aroma profiles of Saccharomyces cerevisiae strains from diverse origins. BMC Genomics 18(1):455. doi: 10.1186/s12864-017-3816-1.
Ochando T, Mouret JR, Humbert-Goffard A, Sablayrolles JM, Farines V. (2017). Impact of initial lipid content and oxygen supply on alcoholic fermentation in champagne-like musts. Food Res Int. 98:87-94. doi: 10.1016/j.foodres.2016.11.010.
Rollero S, Mouret JR, Bloem A, Sanchez I, Ortiz-Julien A, Sablayrolles JM, Dequin S, Camarasa C. (2017). Quantitative 13 C-isotope labelling-based analysis to elucidate the influence of environmental parameters on the production of fermentative aromas during wine fermentation. Microb Biotechnol. 10(6):1649-1662. doi: 10.1111/1751-7915.12749.
